Сумму в договоре нужно отражать с учетом НДС подлежащего оплате, либо НДС начисляется и уплачивается на стоимость услуг?

 Цену товара (работы, услуги) в договоре нужно указывать вместе с НДС и дополнительно выделять НДС. В этом случае продавец и покупатель точно знают то, что в цену включен НДС, и его размер.

Если НДС не выделен, то считается, что цена в договоре включает НДС по умолчанию (п. 17 Постановления Пленума ВАС РФ от 30.05.2014 N 33).

Начислять НДС сверх цены договора нельзя (только в исключительных случаях). Поэтому в распоряжении продавца останется сумма меньшая, чем в договоре.

Если продавец не выделил НДС в договоре, но при расчетах начислил его сверх цены, может возникнуть спор с покупателем.