На ЕНС организации имеется сейчас положительное сальдо. Можно ли не вносить платеж ЕНП, а просто подать уведомление?

Да, организация вправе не производить платеж, если на ЕНС уже имеется положительное сальдо на нужную сумму.

Налоговый орган может зачитывать "переплату" и самостоятельно (без вашего заявления) в очередности, установленной законом (п. 8 ст. 45 НК РФ). По общему правилу он это делает при наступлении сроков уплаты налогов, авансовых платежей, сборов, страховых взносов. В некоторых случаях зачет производится и раньше - до наступления срока платежа по налогу, страховым взносам на ОПС, ОМС, по ВНиМ. Так, при определенных условиях налоговый орган зачитывает "переплату" в счет исполнения предстоящей обязанности по уплате НДФЛ, который исчислен и удержан налоговым агентом, страховых взносов на ОПС, ОМС, по ВНиМ, налогов, уплачиваемых физлицом на основании налогового уведомления (п. п. 7, 8, 9 ст. 78 НК РФ).

Готовое решение: Как осуществляются зачет и возврат сумм, формирующих положительное сальдо единого налогового счета (КонсультантПлюс, 2023) {КонсультантПлюс}