С 1 октября 2023 года в счете-фактуре, оформленном при совершении операций с прослеживаемыми товарами, помимо общих сведений надо указывать реквизиты прослеживаемости (пп. 16 - 19 п. 5 ст. 169 НК РФ. Также реквизиты прослеживаемости нужно отражать в счетах-фактурах, формируемых при передаче таких товаров в составе выполненных работ (п. 5 ст. 169 НК РФ).
В Письме от 23.01.2024 N ЗГ-2-15/791 ФНС России разъясняет порядок оформления счета-фактуры при передаче прослеживаемых товаров в составе выполненных работ.